הדבקה: נגיף הציטומגלי עובר מאדם לאדם. ניתן לבודדו מהפרשות שונות כדוגמת רוק, דם, שתן, צואה ודמעות. הוירוס מצוי גם בהפרשות מהוגינה, נוזל הזרע וכן בחלב אם. דרך ההעברה העיקרית היא באמצעות מגע ישיר עם הפרשות נגועות, אם כי גם חפצים שבאו במגע עם הפרשות יכולים להוות מקור להדבקה.
מעונות יום לפעוטות הינם מקור להתפשטות מהירה של נגיף הציטומגלו ולעיתים שיעור התחלואה עלול להגיע ל-50-70 % מקרב השוהים במעון. נשים עם ילדים קטנים שילדיהן שוהים במעונות יום נמצאות, לכן, בסיכון מוגבר להדבקות בנגיף.
הדבקת העובר והילוד: הדרך השכיחה להדבקה מולדת בנגיף היא מעברו דרך השליה. בנשים שנדבקו לראשונה בוירוס במהלך הריונן, שיעור ההעברה לעובר הינו בממוצע 40% כאשר ב-5-15% מהעוברים תמצא עדות כלשהי למחלה קלינית. לרוב העוברים החולים (90%) יהיו תסמינים כבר עם לידתם כאשר ב-10% הביטוי הקליני יופיע מאוחר יותר. לאחר זיהום חוזר קיים סיכון קטן יותר, אם כי לא זניח למחלה בעובר, כ-1-2%.
מגע עם הפרשות לידניות נגועות במהלך הלידה או העברה דרך חלב אם אינם גורמים בדרך כלל למחלה בילוד.
הסתמנות קלינית במבוגרים: רוב המבוגרים הבריאים עם זיהום ראשוני או חוזר בנגיף הציטומגלי הינם ללא תסמינים. ביטויים קליניים אפשריים הינם דמויי מונונוקלאוזיס כחום, תחושה כללית רעה ועייפות.
סיבוכים לעובר: הדבקת העובר בשליש הראשון להריון גורמת בדרך כלל למחלה קשה יותר בעובר ובילוד בהשוואה לזיהום בשלבים מאוחרים יותר. עם זאת, קיימים סיבוכים לעובר גם בעקבות הדבקה בשליש השני ואף השלישי להריון. ביטויי המחלה בעובר הינם רב-מערכתיים וכוללים היקף ראש קטן, הסתיידויות מוחיות, עיכוב בגדילה תוך-רחמית, הגדלת הכבד והטחול, הפרעות ראיה והפרעות שמיעה. הפגיעה הקשה ביותר בעובר הינה נזק עצבי-התפתחותי. הביטויים הנפוצים לנזק כזה הינם חרשות עצבית ופגיעה בראיה עד עיוורון. תתכן גם פגיעה קוגנטיבית כגון הפרעות התנהגות וקשיי למידה ועד פיגור שכלי קשה. במקרים רבים יש קושי לאמוד את חומרת הפגיעה בעובר טרם הלידה.